Protista
Царство Protista Haeckel 1866, простейшие или протисты
Тип Foraminifera d'Orbigny 1826
Авторы: Е М. Майер, С.А. Корсун
Морские, бентальные виды
Класс Astrorhizata Saidova 1981
Класс Spirillinata Maslakova 1990
Класс Miliolata Saidova 1981
Класс Monothalamea Haeckel, 1862 (as emended by Pawlowski et al., 2013)
Класс Nodosariata Mikhalevich 1992
Класс Rotaliata Mikhalevich 1980
Тип Nucleariomorpha Mikrjukov 2000
Тип Sarcomonada Cavalier-Smith 1993
Класс Cercomonadea Mikrjukov 2000
Класс Саркомонадовые (Sarcomonadea Cavalier-Smith)
Тип Ochrophyta Cavalier-Smith 1995
Класс Silicophycea Rothmaler 1951
Класс Dictyochophyceae
Класс Chrysophyceae
Тип Centroheliozoa Dürrschmidt & Patterson 1987
Класс Centrohelea Cavalier-Smith 1993
Тип Rhizopoda Siebold 1845, корненожки
Автор: А.А. Бобров
Сборы почвенных проб А.А. Рахлеевой.
Почвенные сборы были проведены на побережье Лапшагинской губы (часть Нильмогубы) - 9 км на юго-восток от ББС. Окрестности деревни Чёрная речка. Были исследованы почвы сосняка бруснично-шикшиево-лишайникового, сосняка с елью чернично-бруснично-багульниково-зеленомошного, |ельника с единичной сосной сфагново-долгомошного, сосняка сфагново-морошкового и мезотрофное сфагновое болото.
Класс Lobosea Carpenter 1861
Подкласс Testacealobosia de Saedeleer 1934
Класс Filosea Leidy 1879
Подкласс Testaceafilosia de Saedeleer 1934
Класс Metromonadea Cavalier-Smith 2007, emend. Cavalier-Smith 2011
Тип Ciliophora Doflein 1901, инфузории
Автор: И.В. Бурковский
В список включены 279 видов свободноживущих активно перемещающихся инфузорий, обитающих в грунте и толще воды (включая 15 пресноводных видов, часто проникающих на опресняемую литораль (в кутовых частях губ) и выдерживающих длительное осолонение до 12-16‰). Места регистрации видов – Великая Салма, губы Ругозёрская, Кислая, Чернореченская. Не включены свободноживущие виды инфузории, обитающие на естественных и искусственных субстратах (кругоресничные и суктории), комменсальные виды (хонотрихи), симбиотические и паразитические виды, требующие специального изучения и ревизии. Список основан на собственных данных И. В. Бурковского, частично опубликованных (Бурковский, 1970; Бурковский и др., 1974).
Класс Kinetofragminophorea de Puytorac et al. 1974
Подкласс Gymnostomatia Bütschli 1889
Подкласс Vestibulifera de Puytorac et al. 1974
Надотряд Phillopharyngidea de Puyterac et al. 1974
Класс Oligohymenophorea de Puytorac et al. 1974
Подкласс Hymenostomatia Delage et Herouard 1896
Класс Polyhymenophorea Jankowski 1967
Подкласс Spirotrichia Bütschli 1889
- Отряд Heterotrichida Stein 1859
- Отряд Oligotrichida Bütschli 1887
- Отряд Hypotrichida Stein 1859
- Виды неясной таксономической принадлежности, предположительно из отряда Karyorelictida
Тип Choanozoa Cavalier-Smith 1981
Автор: Mindolina et al., 2023
Род Monosiga W.S.Kent, 1878
- Monosiga ovata Kent, 1881 - мор. гетеротрофн. жгутиконосцы, найдены в аэробной зоне полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023); культивирована из проб воды из меромиктического оз. Трехцветное (Миндолина, 2025).
Род Savillea (W.N. Ellis) Loeblich III, 1967
- Savillea parva (Ellis) Loeblich III - мор. гетеротрофн. жгутиконосцы, найдены в аэробной зоне полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023).
Род Diaphanoeca W.Ellis, 1930
- Diaphanoeca grandis Ellis, 1930 - мор. гетеротрофн. жгутиконосцы, найдены в аэробной зоне полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023).
Род Stephanoeca W.Ellis, 1930
- Stephanoeca paludosa - найдены в аэробной зоне полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое" на глубине от 0 до 2–2,5 м (Mindolina et al., 2023).
Род Saviella (W.N. Ellis) Loeblich III, 1967
- Saviella parva (Ellis) Loeblich III - мор.; найдены в аэробной зоне полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое"(Mindolina et al., 2023).
Тип Bigyra
Тип Sulcozoa
Класс Ancyromonadida
Семейство Ancyromonadidae Cavalier-Smith, 1993
Род Ancyromonas W.S.Kent, 1881
- Ancyromonas sigmoides W.S.Kent, 1881 - морской, гетеротрофный, в нижней части аэробной зоны полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023) и в меромиктическом оз. Трехцветное (Миндолина, 2025).
Тип Metamonada
Fornicata
Организмы, подобные Carpediemonas
Род Carpediemonas Ekebom, Patterson & Vors, 1996
- Carpediemonas membranifera - анаэробные жгутиконосцы; найдены в полуизолированной стратифицированной лагуне "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023)
Род Kipferlia Kolisko et al., 2010
- Kipferlia bialata - найдены в анаэробной зоне полуизолированной стратифицированной лагуны "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023).
Superphylum Discoba
Order Jakobida
Семейство Histionidae
Род Reclinomonas Flavin & Nerad, 1993
- Reclinomonas americana Flavin & Nerad 1993 - пресн., гетеротроф; найдены в полуизолированной стратифицированной лагуне "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023).
Тип Euglenozoa Cavalier-Smith, 1981
Семейство Neobodonidae Cavalier-Smith, 2016
Род Neobodo Vickerman, 2004
- Neobodo designis (Skuja) Vickerman - мор., найдены в полуизолированной стратифицированной лагуне "Озеро Кисло-Сладкое", только в верхней части солоноватого миксолимниона на глубине 0–0,5 м (Mindolina et al., 2023).
- Neobodo curvifilus (Bodo curvifilus Griessmann, 1913) - мор., гетеротрофн. жгутиконосцы; найдены в полуизолированной стратифицированной лагуне "Озеро Кисло-Сладкое", только в верхней части солоноватого миксолимниона на глубине 0–0,5 м (Mindolina et al., 2023).
Семейство Bodonaceae Bütschli, 1884
Род Bodo Ehrenberg 1830
- Bodo minimus Klebs 1893 - пресн.,; в планкт. меромиктического оз. Трехцветное (Миндолина, 2025).
- Bodo saltans Ehrenberg 1832 - пресн., мор.; в планкт. меромиктического оз. Трехцветное (Миндолина, 2025).
Род Rhynchomonas Klebs, 1892
- Rhynchomonas nasuta (Stokes) Klebs, 1892 - мор. и пресн. гетеротроф; найдены в полуизолированной стратифицированной лагуне "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023) и в планкт. меромиктического оз. Трехцветное (Миндолина, 2025).
Семейство Neometanemidae Cavalier-Smith, 2016
Род Neometanema W.J.Lee & A.G.B.Simpson, 2014
- Neometanema exaratum (J.Larsen & D.J.Patterson) W.J.Lee & A.G.B.Simpson, 2014 - мор.; найдены в полуизолированной стратифицированной лагуне "Озеро Кисло-Сладкое" (Mindolina et al., 2023).
Тип Apicomplexa Levine 1970
Класс Gregarinomorpha Dufour 1828, грегарины
Автор: Т. Г. Симдянов
Морские паразитические формы
Класс Coccidea Leuckart 1879, Кокцидии
Protozoa incertae sedis
Класс Ebriophyceae
Семейство Ebriaceae Lemmermann, 1901
Род Ebria Borgert, 1891
- Ebria tripartita (Schumann) Lemmermann, 1899 - мор., массовый вид в соленых лагунах (оз. Кисло-Сладкое, лагуна на Зеленом мысе) (собств.). Массово в лагуне на Зеленом мысе ниже пикноклина на глубине 1–1.5 м (Mindolina et al., 2023).
Incertae sedis Eukarya: Hemimastigophora Foissner et al. 1988
Род Paramastix Skuja, 1948
- Paramastix conifera Skuja 1948 - пресн.; в планктоне меромиктического оз. Трехцветное (Mindolina, 2025).