Порядок Pyrenomonadales

Род Komma D. R. A. Hill

Komma caudata (L. Geitler) D. R. A. Hill (=Chroomonas acuta Utermöhl) – планкт., ред., пресн. супр. ванна, Ругоз. г.

Род Proteomonas Hill & Wetherbee

Proteomonas sulcata Hill & Wetherbee – планкт., ред., опресн. лит. лужи, верхн. лит., Ерем. губа; ед., солон. супр. ванна, м. Киндо.

Род Teleaulax D.R.A.Hill 1991

Род Rhodomonas Karsten

Rhodomonas baltica Karsten - планкт., ед., лит. ванна, около пирса ББС.
Rhodomonas lacustris Pascher & Ruttner – планкт., об., мелководные пресн.
Rhodomonas lens Pascher & Ruttner — планкт., ед., оз. В. Ерш.
Rhodomonas marina (Buttner) (Dangeard) Lemmermann (=Chroomonas marina (Buttner) Butcher – мор., планкт. (Rat’kova, 2000).
Rhodomonas minuta Skuja – планкт., об., пресн. супр. ванны, оз.
Rhodomonas salina (Wislouch) D. R. A. Hill & R. Wetherbee (=Pyrenomonas salina (Wislouch) Santore, Cryptomonas salina Wislouch; Chroomonas salina (Wislouch) Butcher] – планкт., об., В. Салма, солон. супр. ванны.
Rhodomonas sp. RCC2020 (GenBank номер KF039722) (=Cryptomonas cf. rufescens Skuj, внесенный в Каталог 2008 года издания, 11.08.2002 — сбор С.И. Шапоренко, определение Е.А. Кузнецова). По гену 18s РНК определен как представитель рода Rhodomonas (Краснова и др., 2014)) – планкт., масс. цветение воды красным цветом в хемоклине некоторых прибрежных меромиктических озер, в т.ч. лагуны на Зеленом мысе и оз. Кисло-Сладкого).

Cryptophyta incertae sedis

Род Cyathomonas De Fromentel.

Cyathomonas truncata (Fresenius) Fromentel – планкт., об., пресн. супр. ванны.

Род Phyllomitus Stein

Род Sennia Pascher